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MySQL 互換データベースエンジンを組み込んだパワフルなJava アプリケーションを短時間・低コストで作成して配布できます。

MySQL データをR で分析

CData JDBC Driver で標準的なR 関数とお好みの開発環境を使ってMySQL を分析。

加藤龍彦
デジタルマーケティング

最終更新日:2023-09-21
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CData

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こんにちは!ウェブ担当の加藤です。マーケ関連のデータ分析や整備もやっています。

Pure R スクリプトおよび 標準SQL を使って、R およびJava をインストール可能なあらゆるマシン上でMySQL にアクセス。CData JDBC Driver for MySQL とRJDBC package を使って、R でリモートMySQL データ を利用できます。CData Driver を使うことで、業界が認めた基準で書かれたドライバーを活用して、オープンソースでポピュラーなR 言語のデータにアクセスできます。この記事では、ドライバーを使ってMySQL にSQL クエリを実行する方法、および標準R 関数を呼び出してMySQL をビジュアライズする方法について説明します。

R をインストール

マルチスレッドのMicrosoft R Open を実行すること、またはBLAS/LAPACK ライブラリにリンクされたオープン R を実行することによって、マルチスレッドおよびマネージドコードから利益を得られたドライバーのパフォーマンスにマッチできます。ここでは、Microsoft R Open 3.2.3 を使用します。CRAN レポジトリのJan. 1, 2016 snapshot からパッケージをインストールするために事前設定されています。このsnapshot は再現性を保証します。

RJDBC パッケージをロード

ドライバーを使うにはRJDBC パッケージをダウンロードします。RJDBC パッケージをインストールしたら、次のコードを入力してパッケージをロードします。

library(RJDBC)

JDBC データソースとしてMySQL に接続

下記の情報を使いMySQL にJDBC データソースとして接続します。

  • Driver Class:cdata.jdbc.mysql.MySQLDriver に設定。
  • Classpath:Driver JAR の場所を設定します。デフォルトではインストールディレクトリの[lib]サブフォルダです。

dbConnect やdbSendQuery のようなDBI 関数は、R にデータアクセスコードを書くための統一インターフェースを提供します。

driver <- JDBC(driverClass = "cdata.jdbc.mysql.MySQLDriver", classPath = "MyInstallationDir\lib\cdata.jdbc.mysql.jar", identifier.quote = "'")

これで、DBI 関数を使ってMySQL に接続しSQL クエリを実行する準備が整いました。dbConnect 関数を使ってJDBC 接続を初期化します。一般的なJDBC 接続文字列は次のとおりです。

conn <- dbConnect(driver,"User=myUser;Password=myPassword;Database=NorthWind;Server=myServer;Port=3306;")

Server およびPort プロパティがMySQL への接続には必須です。IntegratedSecurity をFALSE に設定した場合、User、Password も必須になります。 オプションで、Database を設定することもできます。Database は設定がない場合すべてのデータベースを使えるようになります。

パスワード方式によるSSH 接続

パスワード方式によるSSH接続時に必要なプロパティ一覧を以下に示します。

  • User: MySQL のユーザ
  • Password: MySQL のパスワード
  • Database: MySQL の接続先データベース
  • Server: MySQL のサーバー
  • Port: MySQL のポート
  • UserSSH: "true"
  • SSHAuthMode: "Password"
  • SSHPort: SSH のポート
  • SSHServer: SSH サーバー
  • SSHUser: SSH ユーザー
  • SSHPassword: SSH パスワード

接続文字列形式では以下のようになります。

User=admin;Password=adminpassword;Database=test;Server=mysql-server;Port=3306;UseSSH=true;SSHAuthMode=Password;SSHPort=22;SSHServer=ssh-server;SSHUser=root;SSHPassword=sshpasswd;

公開鍵認証方式方式によるSSH 接続

公開鍵認証によるSSH接続時に必要なプロパティ一覧を以下に示します。

  • User: MySQL のユーザ
  • Password: MySQL のパスワード
  • Database: MySQL の接続先データベース
  • Server: MySQL のサーバー
  • Port: MySQL のポート
  • UserSSH: "true"
  • SSHAuthMode: "Public_Key"
  • SSHClientCertType: キーストアの種類
  • SSHPort: SSH のポート
  • SSHServer: SSH サーバー
  • SSHUser: SSH ユーザー
  • SSHClientCert: 秘密鍵ファイルのパス

接続文字列形式では以下のようになります。

User=admin;Password=adminpassword;Database=test;Server=mysql-server;Port=3306;UseSSH=true;SSHAuthMode=Public_Key;SSHClientCertType=PUBLIC_KEY_FILE;SSHPort=22;SSHServer=ssh-server;SSHUser=root;SSHClientCert=C:\Keys\key.pem;

スキーマ Discovery

ドライバーはMySQL API をリレーショナルデータベース、ビュー、ストアドプロシージャとしてモデルします。次のコードを使ってテーブルリストを検出します。

dbListTables(conn)

SQL クエリの実行

dbGetQuery 関数を使ってMySQL API がサポートするすべてのSQL クエリを実行できます:

orders <- dbGetQuery(conn,"SELECT ShipName, Freight FROM Orders")

次のコマンドを使って、結果を[data viewer]ウィンドウで見ることができます。

View(orders)

MySQL データ をプロット

CRAN レポジトリで利用可能なあらゆるデータ初期化パッケージを使ってMySQL を分析する準備が整いました。ビルトインバーのplot 関数を使って簡単なバーを作成できます。

par(las=2,ps=10,mar=c(5,15,4,2)) barplot(orders$Freight, main="MySQL Orders", names.arg = orders$ShipName, horiz=TRUE) A basic bar plot. (Salesforce is shown.)

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